風(fēng)力發(fā)電對鳥類也構(gòu)成了威脅，鳥類常常撞死在渦輪機旋轉(zhuǎn)的葉片上。日本環(huán)境省證實，從2003財年開始，13只罕見物種白尾雕就這樣被奪去生命。日本野鳥協(xié)會（Wild Bird Society of Japan）自然保護辦公室副主任Yukihiro Kominami認(rèn)為，這些例子僅是冰山一角。他說：“我們必須盡快找出各個地區(qū)存在的類似問題，否則我們將看到鳥類繼續(xù)受到傷害。”
　　也有人認(rèn)為，風(fēng)力渦輪機旋轉(zhuǎn)的大葉片破壞了當(dāng)?shù)鼐坝^。日本長野市的居民組織起來，反對在當(dāng)?shù)亟ㄔO(shè)風(fēng)力發(fā)電場，當(dāng)?shù)卣€制作了一張地圖，顯示了擬建的風(fēng)力發(fā)電場對自然和景觀的影響。一名負(fù)責(zé)人表示：“我們希望運營商能夠評估環(huán)境問題，并借助此圖向當(dāng)?shù)鼐用窠忉屒宄?rdquo;
　　專家們?nèi)找孢_(dá)成共識，認(rèn)為風(fēng)力發(fā)電項目應(yīng)該被納入到環(huán)境影響評估法律中。環(huán)境省計劃在中央環(huán)境審議會（Central Environmental Council）上探討這個設(shè)想，研究修改法律的可能性。
　　非盈利環(huán)保組織日本可持續(xù)能源政策研究所負(fù)責(zé)人Tetsuya Iida表示：“風(fēng)力發(fā)電已經(jīng)取得商業(yè)成功，比太陽能發(fā)電成本低。必然存在一種風(fēng)電與自然和居民和諧共處的途徑，日本政府應(yīng)該考慮建立一個框架，協(xié)助探尋這種方式。”